Cosa sono i peptidi penetranti nelle cellule?

I peptidi penetranti nelle cellule sono piccoli peptidi che possono facilmente penetrare nella membrana cellulare.Questa classe di molecole, in particolare i CPP con funzioni di targeting, è promettente per un efficiente rilascio di farmaci alle cellule bersaglio.

Pertanto, la ricerca su di esso ha un certo significato biomedico.In questo studio, i CPP con diverse attività transmembrana sono stati studiati a livello di sequenza, cercando di scoprire i fattori che influenzano l'attività transmembrana dei CPP, le differenze di sequenza tra CPP con attività diverse e NonCPP e introdurre un metodo per analizzare le sequenze biologiche.

Le sequenze CPP e Non CPP sono state ottenute dal database CPPsite e da diverse letterature, e peptidi transmembrana (HCPP, MCPP, LCPP) con attività transmembrana alta, media e bassa sono stati estratti dalle sequenze CPP per costruire set di dati.Sulla base di questi dati sono stati condotti i seguenti studi:

1, La composizione degli aminoacidi e della struttura secondaria di diversi CPP attivi e Non CPP è stata analizzata mediante ANOVA.Si è scoperto che le interazioni elettrostatiche e idrofobiche degli amminoacidi hanno svolto un ruolo importante nell'attività transmembrana dei CPP, e anche la struttura elicoidale e l'avvolgimento casuale hanno influenzato l'attività transmembrana dei CPP.

2. Le proprietà fisiche e chimiche e le lunghezze dei CPP con diverse attività sono state visualizzate sul piano bidimensionale.Si è scoperto che CPP e Non CPP con attività diverse potevano essere raggruppati sotto alcune proprietà speciali, e HCPP, MCPP, LCPP e Non CPP erano divisi in tre cluster, mostrando le loro differenze;

3. In questo articolo viene introdotto il concetto di centroide fisico e chimico della sequenza biologica e i residui che compongono la sequenza sono considerati punti di particelle e la sequenza viene astratta come un sistema di particelle per la ricerca.Questo metodo è stato applicato all'analisi dei CPP proiettando CPP con diverse attività sul piano 3D mediante il metodo PCA e si è riscontrato che la maggior parte dei CPP si raggruppavano insieme e alcuni LCPP si raggruppavano insieme ai NonCPP.

Questo studio ha implicazioni per la progettazione dei CPP e per la comprensione delle differenze nelle sequenze dei CPP con attività diverse.Inoltre, il metodo di analisi del centroide fisico e chimico delle sequenze biologiche introdotto in questo articolo può essere utilizzato anche per l'analisi di altri problemi biologici.Allo stesso tempo, possono essere utilizzati come parametri di input per alcuni problemi di classificazione biologica e svolgono un ruolo nel riconoscimento di modelli.